我站与清华大学刘晓教授课题组合作开发pBACode 库取得新进展

我站积极拓展科研项目合作渠道，与清华大学刘晓教授课题组开展科研合作开发pBACode 库，建立牙鲆基因组物理图谱，目前牙鲆研究已生成了初步基因组序列草图和遗传图谱。本项目是开发一种新的高通量BAC库两端测序方法，建立牙鲆基因组物理图谱，基于2014年我站创制的牙鲆克隆系，利用序列标签（Barcode pairs）技术，构建了牙鲆pBACode 库。BAC库包含94,464克隆，每个克隆基因组插入片段长度平均为150kb，其中95.4%的克隆具有序列标签序列，通过barcodes高通量测序定位每一个克隆的位置。我站创制的牙鲆克隆系纯合度大于99 %，非常适合用于基因组组装，结合BAC库末端测序进行基因组预装配，装配质量可提高10倍以上，该成果现已发表在?Nucleic Acids Research（IF9.58）（DOI: 10.1093/nar/gkw1261）。